本季延续《西行纪》前一季剧情，讲述了唐三藏与师徒四人取得奇经交予天宫的十六年后，为了心中正义，再次集结成“西行小队”，重新踏上“还经”之路的故事。
洛云霄穿越到了玄幻世界，被正道人士派往万魔宗做卧底。十年前，他被老宗主收为徒弟，就在前不久老宗主过世了，而他这个亲传弟子自然就顺理成章的成了宗门的继承人。洛云霄知道，他们之所以推选他故宗主，不过是想让他当替死鬼，幸好在关键时刻，他激活了系统，有了系统的帮助，他将万魔宗打造成了最强宗门。
在Zi行星有一群被称为机兽的金属生物体，有些拥有惊人战斗力，但它们必需得到由特别发电机产生的红色凝胶才可运作。该行星在古代曾经存在超高科技文明，却发生了一场被称为“众神之怒”的大灾难，当时有一部份人类...
150年前，世界迎来末世，所有城市变成废墟。灾变后，生物发生未知的进化，被称为妖兽的怪物遍布世界，人类被迫建立起一座座基地城镇得以生存，而拥有各种对付妖兽能力的镖师成为新世界中连接人类聚居地的重要存在。少年陆仁伽为了调查师兄死亡的真相成为了镖师，活跃于东南片区，在历经镖局任务的各种冒险后逐渐接近真相……
碧落大陆上苏将军府的四小姐，一个修炼的废柴，人人得而虐之。唯独晋王南宫流云对苏落另眼相看，带她重回神殿，测定其为木火双系炼丹师，并且因为体内的龙之戒拥有几乎绝迹的空间能力。为开启空间能力，两人前往日落山脉屠龙，阴险的情敌李瑶瑶从中作梗，以身引魔兽骗取南宫的救助，又派人追杀苏落。苏落虽然得到小神龙，成功开启空间制服追杀者，但还是中了李瑶瑶的离间计，令南宫挡箭重伤，陷入灵魂紊乱的绝命境地。
