这部全新“星战”动画系列《星球大战：反叛军》的故事发生在介于《星战》第三章和第四章之间（摧毁最后的绝地武士的帝国反击战）的纪元。而《星球大战：克隆战争》动画系列片导演戴夫·费罗尼将出任这部全新动画系列的监制。片中的艺术概念则将采用曾为“星战”系列电影设计过经典角色和场景的 已故科幻大师拉尔夫·麦考瑞的作品。《星球大战：反叛军》将延续星球大战冒险史诗的传统。这是银河系的黑暗时刻，邪恶的银河帝国以铁血统治占领了一个偏远的星球并行使种种破坏其人民生活的恶行，但有一群人勇敢地站起来反抗。这一群人将面临威胁恶棍的威胁，经历惊心动魄的冒险，而成为英雄。
天赋异禀的灵宠师樊凌霄，于甲级门派晋升赛上遭人暗算，被自己的灵鲲所吞噬。睁眼醒来却发现自己已化身为一名叫“流锋芒”的少年，身处白府大牢之中，其门派凌霄阁也走到了绝境。为查明灵鲲反噬真相与重振门派，樊凌霄带着现有的几只灵宠，与谷灵、程曦、月彤，一起踏上了全新的冒险之旅。
未来世界库库鲁长大成人，即将加冕成为古灵仙族的国王，女神安琪儿与新一任花仙魔法使者“圣洁之光”雪城爱一起守护着拉贝尔大陆的和平，人们生活在宁静祥和之中。然而黑暗魔王借着人们内心的私欲逐渐壮大，他利用芬妮公主对安琪儿的嫉妒之心再一次发动侵袭，妄图抢夺神秘力量，花之法典中的花仙精灵被尽数黑化，拉贝尔大陆岌岌可危。危急关头，安琪儿女神不得不打开时空之门，将雪城爱与库库鲁送回过去的地球，去找到那个命定的魔法少女寻求帮助……
