在東京出現了一些可以實現人類願望，甚至復製人類思想的神殿石柱。据說這些石柱，本來已一萬多年沉沒於海底，今次再現，原來又是外星人策動的計劃。他們把人類的思想複製到石柱去，然後再把思想轉為訊號，利用這些訊號操控機械巨獸，於是地球的 存亡與否，便決定於人類本身思想的好與壞了。一位少女不滿父親無惡不作的所為，於是向石柱許願，把父親邪惡的思想吸掉，結果，喚醒了巨獸邪惡的慾念 ，在地球到處破壞……七星俠為了拯救人類，又要和外星人周旋到底了。
冷酷无情的邪恶组织参谋，某天遇见了与之对抗的魔法少女，然后对魔法少女一见锺情了。从此邪恶参谋在策划统治世界时也不忘买甜点蛋糕送魔法少女吃、在计划奴役人类时也不忘关心魔法少女、在壮大邪恶组织势力的同时也不忘和魔法少女打情骂俏。同事来帮忙就扯同事的后腿、部下抓住魔法少女就放 走魔法少女，一场最残忍最傲娇最悲戚最可爱的正与邪的搞笑战斗，在此揭开序幕！
第12季讲述了白月初被涂山雅雅带到危险的“圈外”发动了她的独门绝技镜花缘，唤醒了白月初失落的记忆，揭开了东方月初当年是如何在道盟推动人和妖和平的背后故事。
