《学姐是男孩》续作跃上大银幕，交织着成长痛的青春物语将划下感动终章。
与七大不可思议中的第七号、“厕所的花子”中的花子君结下不解之缘的少女：八寻宁宁。驱魔师一族的少年：源光。两人与花子君一起，为了将发生异变的七大不可思议以及怪异的传闻恢复原状，每日奔忙不停。忽一日，花子君说道：七大不可思议中出了背叛者。宁宁等人为了找出背叛者，开始逐一摧毁七大不可思议的依附物。他们已经摧毁了第二号“岬的楼梯”以及第五号“16时的书库”，剩下包括“厕所的花子”在内的五个…而在暗中，花子君的弟弟司，召集了七峰樱、日向夏彦、以及新成为七大不可思议第三号“镜地狱”的三叶，接近了宁宁等人尚未找到的七大不可思议……
在充满奇幻能量与多元生命形态的异世界中，青年守护者唐卡凭借独特的感知能力"星辰之眼"维护不同族群间的和谐共处，少女庄小冉突发意外，觉醒了能与神秘能量产生共鸣的特殊体质，踏入这个奇妙的异世界。被唐卡救助后，两人在相处中发现了她的身世之谜，因此揭开两个古老组织"自然守护团"与"生命议会"的理念碰撞。
