延续TV版的主线剧情，继续讲述从战场回来的少女薇尔莉特·伊芙加登为了理解“爱”的含义而从事为有需要的人们写信传情的工作。薇妹一直挂念的少佐的下落大概率会在这部剧场版中讲述。
海蟹游客与泽西海岸的陆蟹镇居民发生冲突。
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某座小岛即将上演一出冒险戏剧，这正是伟大艺术家兰多鲁夫的引退演出。距离出海还有一段时间，路飞、乌索普、乔巴、娜美、山治等草帽海贼团的伙伴们闲极无聊，决定留下来观看演出。这几个无忧无虑的家伙跑进剧团的后台，穿上戏服玩起了角色扮演，乐在其中。就在此时，他们听到舞台上传来的砍杀声。原来，那正是兰多鲁夫与剧团成员在排练。这位老人气力已衰，却仍坚持演出，然而本应出演公主的女演员却突然辞演，离开剧团。眼看晚上的公演即将取消，娜美却突然走上前台主动请缨，草帽海贼团的各位也一拥而上要求扮演角色。兰多鲁夫难忘的告别演出即将开场……
哈尔?乔丹（Hal Jordan）原本是一名试飞员，后被飞船在地球坠毁的绿灯侠Abin Sur的戒指召唤成为“绿灯侠”、负责保卫地球和银河地区的治安。在多年的战斗中他立下了赫赫功劳，被称为“史上最伟大的绿灯侠”，同时也是“正义联盟”（JLA）的创立者之一。
千年之前，一场可怕的战争燃烧了整片大地。蚩尤将战火引向各处，最终他被黄帝打败，遭到封印。然而野心勃勃的帝王秦始皇派出铁骑入侵楼兰，寻找传说中的可怕武器“兵魔神”。某边塞小镇，顽皮机警的少年荆天明（冯骏骅 配音）意外卷入一场最敬爱的吕老伯（程玉珠 配音）和神秘阴阳家的纷争之中，在被追杀的关键时刻，他得到了天下第一剑客盖聂（刘钦 配音）和项氏一族少主项小羽（沈达威 配音）的援助。吕老伯此前曾叮嘱天明将一个神秘物件送到楼兰，而他和盖聂、项小羽等人的邂逅，也无疑使他的命运发生巨大的转变。 秦汉之际，风起云涌，英雄辈出，天明他们见证着一个又一个传奇时刻……
战争之后，日本被分为南北两个部分。美军统治下的青森县，少年藤泽浩纪和白川拓也都喜欢同年级的同学泽度佐由理。他们的心中都有佐由理，还有那个东西——边境以北的津轻海峡，日本北海道联盟建立的高耸云端的“塔”。巨大而神秘的的塔，是三位少年少女的向往，他们约定，建造小型飞机，飞向 塔去一探究竟。 中学三年级佐由理转学到东京。两位少年放弃了制造飞机的打算。浩纪考进东京的高中，拓也继续留在青森的高中就学，彼此在各自的道路上越走越远。 但是，多年后，佐由理在医院中陷入沉睡！这突如其来的病症让三人再次聚在一起。沉睡的病症，与塔的力量有神秘的联系，而塔本身，似乎也成了日本南北开战的据点。 卷入战争与爱情的三人，到底是救佐由理，还是救世界！命运的解答，似乎就在云的那一端，他们曾经约定的地方。
住在天空与海洋辉映的城镇“藤泽”的梓川咲太，就读高中二年级。
在家长重重压力下想要离家出走的大雄（大原惠美 配音）、胖虎（木村昴 配音）、小夫（关智一 配音）和静香（嘉数由美 配音），在哆啦A梦（水田山葵 配音）的协助下来到了七万年前的地球。在创造属于自己的世外桃源时，他们偶遇神秘少年古古儿，继而被卷入了光明族和黑暗族的部落争斗之中。大家齐心协力智斗巨尊比，不想却发现了一个惊天秘密……
宠物鼠罗迪的奢华生活全被一只从下水道爬上来的流浪鼠西德搅了，无赖西德甚至把罗迪冲进了下水道。从没经历过世事的罗迪简直步入了噩梦一般，他光鲜的衣着和闪亮的皮鞋与肮脏的下水道城市格格不入。不过幸运的他遇到了丽塔，一个独立、勇敢、聪明、强悍的新新鼠类，更重要的是，她是个漂亮的女孩儿。
